Para criar uma caixa de entrada de Whatsapp por QR Code (a conexão da conta do Whatsapp é realizada por leitura de QR Code, semelhante ao Whatsapp Web), você deve ir ao menu principal > Conexões:

Para criar uma nova conexão, clique no botão Nova Conexão:

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O Provedor WAHA não precisa alterar
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Insira o nome da instância - Esse nome deve necessariamente ser escrito sem espaços e sem caracteres especiais
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Clique em criar Instância
Ele vai criar a conexão para você poder conectar seu Whatsapp. Agora ele vai apresentar o QR Code para você fazer a leitura, a partir de seu aplicativo de Whatsapp ou Whatsapp Business (a conexão é compatível com os 2 apps):

Antes das instruções de como realizar a conexão através da leitura do QR Code, seguem as informações sobre a tela acima:
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O QR Code expira em 40 segundos, esteja com o aparelho que tem o Whatsapp em questão, preparado para fazer a leitura
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Faça a leitura do QR Code, conforme orientações abaixo
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Caso o tempo de leitura expire, basta clicar no botão "Gerar Novo QR Code"
Conectando seu Whatsapp na plataforma:
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Abra o WhatsApp no celular
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Toque em Mais opções → Aparelhos conectados
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Toque em Conectar um aparelho
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Aponte a câmera para esta tela
No Android
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Abra o app WhatsApp no seu smartphone;
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Clique no ícone de três pontos no canto superior direito da tela;

No iPhone (iOS):
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Abra o WhatsApp e toque em Configurações
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Selecione “Dispositivos conectados”;
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Escolha a opção “Conectar dispositivos”;

Você também pode configurar o comportamento do Whatsapp conectado à plataforma, clicando na conexão que deseja configurar:

Nos detalhes da conexão, você visualiza as informações do Whatsapp, e as configurações da sessão:

Ative ou desative no Switch que fica azul quando ativado e apagado quando desativado:
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Mostrar nome do agente - Exibe o nome do agente nas conversas com clientes
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Ignorar Grupos - Não receber eventos de grupos do WhatsApp
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Ignorar Status - Não receber eventos de status (stories) do WhatsApp
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Ignorar Listas de Transmissão - Não receber eventos de listas de transmissão
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Rejeitar Ligações - Rejeita automaticamente chamadas de voz e vídeo
Além dos detalhes acima, você pode ativar a integração de chamadas de voz via Whatsapp, diretamente dentro da plataforma, para enviar e receber chamadas, diretamente das conversas, ou dos cards do Kanban. Para ativar, basta solicitar a chave do Wavoip ou inserir a sua:

Você também pode a qualquer momento, desconectar o Whatsapp, clicando no botão "Desconectar Instância".